伊氏錐蟲探針法熒光定量PCR試劑盒設(shè)計引物原則
點擊次數(shù):280 更新時間:2024-08-12
伊氏錐蟲探針法熒光定量PCR試劑盒:
1、引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。
2、引物擴(kuò)增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴(kuò)增長至10kb的片段。
3、引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC好隨機(jī)分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
4、避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),特別是3’端的互補(bǔ),否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶。
5、引物3’端的堿基,特別是zui末及倒數(shù)*個堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗。
6、引物中有或能加上合適的酶切位點,被擴(kuò)增的靶序列zui有適宜的酶切位點,這對酶切分析或分子克隆很有好處。
7、引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。